Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim38Q5SZ99 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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