Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Specc1Q5SXY1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Specc1Q5SXY1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms