Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
9930111J21Rik1Q5SVP0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms