Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PERM1Q5SV97 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PERM1Q5SV97 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PERM1Q5SV97 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms