Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psme4Q5SSW2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psme4Q5SSW2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Psme4Q5SSW2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psme4Q5SSW2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms