Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Trim41Q5NCC3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Trim41Q5NCC3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Trim41Q5NCC3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms