Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1810065E05RikQ5NC41 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
1810065E05RikQ5NC41 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms