Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHC1Q5JVL4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHC1Q5JVL4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHC1Q5JVL4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHC1Q5JVL4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHC1Q5JVL4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms