Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT12Q53H54 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT12Q53H54 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms