Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC38Q502W7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC38Q502W7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC38Q502W7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms