Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KHDC1Q4VXA5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms