Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Xirp2Q4U4S6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xirp2Q4U4S6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xirp2Q4U4S6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xirp2Q4U4S6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xirp2Q4U4S6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xirp2Q4U4S6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xirp2Q4U4S6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xirp2Q4U4S6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xirp2Q4U4S6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xirp2Q4U4S6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms