Protein–RNA interactions for Protein: Q49AJ0

FAM135B, Protein FAM135B, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM135BQ49AJ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FAM135BQ49AJ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FAM135BQ49AJ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FAM135BQ49AJ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
FAM135BQ49AJ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
FAM135BQ49AJ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
FAM135BQ49AJ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FAM135BQ49AJ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FAM135BQ49AJ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FAM135BQ49AJ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms