Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pacs2Q3V3Q7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pacs2Q3V3Q7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pacs2Q3V3Q7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacs2Q3V3Q7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacs2Q3V3Q7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacs2Q3V3Q7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacs2Q3V3Q7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacs2Q3V3Q7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacs2Q3V3Q7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacs2Q3V3Q7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms