Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc110Q3V125 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc110Q3V125 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms