Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY23

Fdxacb1, Ferredoxin-fold anticodon-binding domain-containing protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdxacb1Q3UY23 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fdxacb1Q3UY23 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fdxacb1Q3UY23 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fdxacb1Q3UY23 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fdxacb1Q3UY23 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms