Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clpsl2Q3UW21 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms