Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga4Q3UW12 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnga4Q3UW12 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnga4Q3UW12 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnga4Q3UW12 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga4Q3UW12 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga4Q3UW12 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga4Q3UW12 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga4Q3UW12 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga4Q3UW12 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga4Q3UW12 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga4Q3UW12 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga4Q3UW12 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga4Q3UW12 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.8 ms