Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Skap1Q3UUV5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Skap1Q3UUV5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms