Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTE2

Gm428, Predicted gene 428, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm428Q3UTE2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm428Q3UTE2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm428Q3UTE2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm428Q3UTE2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm428Q3UTE2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm428Q3UTE2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm428Q3UTE2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm428Q3UTE2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms