Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SfswapQ3USH5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SfswapQ3USH5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SfswapQ3USH5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms