Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc33Q3ULW6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc33Q3ULW6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms