Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef1Q3UHC1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef1Q3UHC1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef1Q3UHC1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef1Q3UHC1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef1Q3UHC1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef1Q3UHC1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef1Q3UHC1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef1Q3UHC1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef1Q3UHC1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef1Q3UHC1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef1Q3UHC1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef1Q3UHC1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rapgef1Q3UHC1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef1Q3UHC1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rapgef1Q3UHC1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms