Protein–RNA interactions for Protein: Q3U552

A930003A15Rik, RIKEN cDNA A930003A15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930003A15RikQ3U552 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A930003A15RikQ3U552 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930003A15RikQ3U552 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms