Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gdpd4Q3TT99 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdpd4Q3TT99 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpd4Q3TT99 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms