Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam172aQ3TNH5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam172aQ3TNH5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam172aQ3TNH5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam172aQ3TNH5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam172aQ3TNH5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam172aQ3TNH5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam172aQ3TNH5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam172aQ3TNH5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam172aQ3TNH5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam172aQ3TNH5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam172aQ3TNH5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam172aQ3TNH5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam172aQ3TNH5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms