Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trappc10Q3TLI0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc10Q3TLI0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc10Q3TLI0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms