Protein–RNA interactions for Protein: Q3I5G5

Foxi2, Forkhead box protein I2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxi2Q3I5G5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxi2Q3I5G5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxi2Q3I5G5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Foxi2Q3I5G5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms