Protein–RNA interactions for Protein: Q32NB8

PGS1, CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1Q32NB8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGS1Q32NB8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGS1Q32NB8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms