Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
LRRFIP1Q32MZ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms