Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MICAQ29983 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MICAQ29983 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MICAQ29983 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MICAQ29983 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MICAQ29983 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MICAQ29983 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MICAQ29983 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MICAQ29983 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MICAQ29983 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MICAQ29983 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MICAQ29983 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MICAQ29983 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MICAQ29983 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MICAQ29983 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MICAQ29983 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MICAQ29983 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MICAQ29983 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MICAQ29983 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MICAQ29983 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MICAQ29983 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MICAQ29983 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MICAQ29983 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MICAQ29983 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MICAQ29983 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MICAQ29983 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MICAQ29983 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MICAQ29983 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MICAQ29983 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MICAQ29983 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MICAQ29983 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MICAQ29983 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MICAQ29983 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MICAQ29983 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MICAQ29983 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MICAQ29983 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MICAQ29983 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MICAQ29983 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MICAQ29983 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICAQ29983 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICAQ29983 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICAQ29983 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICAQ29983 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICAQ29983 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICAQ29983 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICAQ29983 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICAQ29983 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICAQ29983 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICAQ29983 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICAQ29983 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MICAQ29983 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MICAQ29983 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MICAQ29983 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MICAQ29983 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MICAQ29983 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MICAQ29983 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MICAQ29983 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MICAQ29983 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MICAQ29983 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MICAQ29983 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MICAQ29983 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MICAQ29983 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MICAQ29983 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MICAQ29983 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MICAQ29983 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MICAQ29983 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MICAQ29983 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MICAQ29983 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MICAQ29983 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MICAQ29983 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MICAQ29983 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MICAQ29983 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MICAQ29983 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MICAQ29983 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MICAQ29983 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MICAQ29983 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MICAQ29983 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MICAQ29983 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MICAQ29983 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MICAQ29983 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MICAQ29983 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MICAQ29983 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MICAQ29983 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MICAQ29983 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MICAQ29983 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MICAQ29983 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MICAQ29983 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MICAQ29983 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MICAQ29983 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MICAQ29983 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MICAQ29983 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MICAQ29983 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MICAQ29983 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms