Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDO1Q16878 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDO1Q16878 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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