Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NRF1Q16656 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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NRF1Q16656 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRF1Q16656 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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