Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK2Q16620 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK2Q16620 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms