Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
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