Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
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KCNMB1Q16558 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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KCNMB1Q16558 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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KCNMB1Q16558 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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KCNMB1Q16558 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNMB1Q16558 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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