Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8Q15843 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEDD8Q15843 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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