Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
NCOA1Q15788 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NCOA1Q15788 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
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