Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NKX1-1Q15270 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NKX1-1Q15270 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NKX1-1Q15270 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
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