Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD3Q15059 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD3Q15059 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
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