Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXOSC7Q15024 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC7Q15024 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms