Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
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