Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX2Q13950 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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