Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK1Q13546 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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