Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGCGQ13326 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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