Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEMA3FQ13275 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3FQ13275 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
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