Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TFCP2Q12800 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TFCP2Q12800 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TFCP2Q12800 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TFCP2Q12800 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TFCP2Q12800 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
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