Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 TSA1YML028W 591 nt6.9□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 HAP3YBL021C 435 nt6.9□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 CIN4YMR138W 576 nt6.9□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 DUG1YFR044C 1446 nt6.9□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 APM1YPL259C 1428 nt6.9□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 ASN1YPR145W 1719 nt6.9□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 SEM1YDR363W-A 270 nt6.89□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 IRC7YFR055W 1023 nt6.89□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 YHR145CYHR145C 357 nt6.89□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 RPL21AYBR191W 483 nt6.89□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 ATG23YLR431C 1362 nt6.89□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 MSN2YMR037C 2115 nt6.88□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 GPA2YER020W 1350 nt6.88□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 TMT1YER175C 900 nt6.88□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 DMA1YHR115C 1251 nt6.88□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 BCY1YIL033C 1251 nt6.88□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.88□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 SLD7YOR060C 774 nt6.88□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 ARG81YML099C 2643 nt6.88□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 YPR204WYPR204W 3099 nt6.87□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 PHO3YBR092C 1404 nt6.87□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 YLR126CYLR126C 756 nt6.87□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 AIM33YML087C 939 nt6.87□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 BSC4YNL269W 396 nt6.87□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 TEL2YGR099W 2067 nt6.86□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 SUB2YDL084W 1341 nt6.86□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 ADE12YNL220W 1302 nt6.86□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 CDC34YDR054C 888 nt6.86□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 GTT3YEL017W 1014 nt6.86□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 YEL068CYEL068C 333 nt6.86□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6.86□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 SHP1YBL058W 1272 nt6.86□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.86□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 IES1YFL013C 2079 nt6.86□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 WHI2YOR043W 1461 nt6.85□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 MDM31YHR194W 1740 nt6.85□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 YCK1YHR135C 1617 nt6.85□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 ACS1YAL054C 2142 nt6.85□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 PGM1YKL127W 1713 nt6.84□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 DEF1YKL054C 2217 nt6.84□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 HST3YOR025W 1344 nt6.84□□□□□ -1.31
CLF1Q12309 SIR2YDL042C 1689 nt6.84□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 CRP1YHR146W 1398 nt6.83□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 VPS61YDR136C 573 nt6.83□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 EGD2YHR193C 525 nt6.83□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 REV7YIL139C 738 nt6.83□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 YNR068CYNR068C 819 nt6.83□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 MRPS5YBR251W 924 nt6.83□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 TKL1YPR074C 2043 nt6.83□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 PRI2YKL045W 1587 nt6.82□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 AVT4YNL101W 2142 nt6.82□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 UGX2YDL169C 672 nt6.82□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 LEU5YHR002W 1074 nt6.82□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 YML012C-AYML012C-A 378 nt6.82□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 YPL102CYPL102C 303 nt6.82□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 YPR114WYPR114W 948 nt6.82□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 GPT2YKR067W 2232 nt6.82□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 DPB2YPR175W 2070 nt6.81□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 PYK2YOR347C 1521 nt6.81□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 MNS1YJR131W 1650 nt6.81□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 YDL023CYDL023C 321 nt6.81□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 DFM1YDR411C 1026 nt6.81□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 PRS2YER099C 957 nt6.81□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 COS6YGR295C 1146 nt6.81□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 YIR042CYIR042C 711 nt6.81□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 YNL200CYNL200C 741 nt6.81□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 TPO3YPR156C 1869 nt6.81□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 SKN1YGR143W 2316 nt6.81□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 VHT1YGR065C 1782 nt6.8□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 PIC2YER053C 903 nt6.8□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 MRS3YJL133W 945 nt6.8□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 ASK1YKL052C 879 nt6.8□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt6.8□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 YTP1YNL237W 1380 nt6.8□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 MSS116YDR194C 1995 nt6.79□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 YMR027WYMR027W 1413 nt6.79□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 ERP5YHR110W 639 nt6.79□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 YJL107CYJL107C 1164 nt6.79□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt6.79□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 SNN1YNL086W 309 nt6.79□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 MRPS12YNR036C 462 nt6.79□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 RDL2YOR286W 450 nt6.79□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 CWC27YPL064C 906 nt6.79□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 FAT3YKL187C 2253 nt6.79□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 PAP1YKR002W 1707 nt6.79□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 COA1YIL157C 594 nt6.78□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.78□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 RAD24YER173W 1980 nt6.78□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 PCL10YGL134W 1302 nt6.77□□□□□ -1.32
CLF1Q12309 YDL172CYDL172C 480 nt6.77□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 COX20YDR231C 618 nt6.77□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 RPT3YDR394W 1287 nt6.77□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 CHL4YDR254W 1377 nt6.77□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 SYF2YGR129W 648 nt6.76□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 NAT5YOR253W 531 nt6.76□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 GLN1YPR035W 1113 nt6.76□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 TFB4YPR056W 1017 nt6.76□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 YPR150WYPR150W 522 nt6.76□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 ISN1YOR155C 1353 nt6.76□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 GUD1YDL238C 1470 nt6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.8 ms