Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hif3aQ0VBL6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hif3aQ0VBL6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms