Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntnap5aQ0V8T9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap5aQ0V8T9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263 ms